结直肠癌预后相关microRNA-mRNA互作用网络的构建开题报告

 2022-03-01 19:54:14

1. 研究目的与意义

本课题研究的背景:

结直肠癌是世界发病率第三高的恶性肿瘤,占全球癌症比例的10%。在2016年,全球有140万人患结直肠癌,69.4万人死于结直肠癌。结直肠癌在发达国家更常见,且男性较女性更容易患结直肠癌。

结直肠癌是直肠部分癌症的衍生,其症状包括排便出血、大便异常、体重减轻以及浑身无力等。多数结直肠癌源于老龄化和生活方式,少数源于遗传疾病基因。导致结直肠癌的风险因素包括:不健康的饮食,过度肥胖,抽烟以及缺少锻炼。在饮食方面红色加工肉类以及酒都会提高患癌症的危险性。炎症性肠疾病包括克罗恩病和溃疡性结肠炎也是引起结肠癌的因素。其他引起结直肠癌的遗传性疾病包括家族性腺瘤息肉病和遗传性非息肉性结肠癌。癌症通常开始是一个良性肿瘤,多为息肉,之后慢慢变成癌症。

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2. 研究内容和预期目标

研究内容:

在本课题的研究中,我们将以结直肠癌microrna表达谱数据及其配对mrna表达谱为研究对象,寻找癌症样本中差异表达的microrna分子,并利用mrna表达谱对microrna候选标记物分子进一步优化,并对其进行诊断力评价。此外,我们还将进一步将microrna标记物分子调控的靶基因映射到分子通路,并利用cytoscape构建microrna-mrna分子调控网络,寻找结直肠癌中microrna调控的模块。

(1) 基因表达芯片数据的收集以及预处理;

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3. 研究的方法与步骤

方法:

(一)根据论文题目,查阅相关文献。

包括正式出版的中外学术期刊和专著。从中选择20篇以上重点参考文献认真阅读,综合分析,写出文献综述,概括出最新研究进展与存在问题。在上述基础上,完成论文开题报告。

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4. 参考文献

[1] xu, l., d. geman, and r.l. winslow, large-scale integration of cancer microarray data identifies a robust common cancer signature. bmc bioinformatics, 2007. 8: p. 275.

[2] cahan, p., et al., meta-analysis of microarray results: challenges, opportunities, and recommendations for standardization. gene, 2007. 401(1-2): p. 12-8.

[3] rhodes, d.r., et al., large-scale meta-analysis of cancer microarray data identifies common transcriptional profiles of neoplastic transformation and progression. proc natl acad sci u s a, 2004. 101(25): p. 9309-14.

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5. 计划与进度安排

本论文的各阶段安排为:

1、2022-03-1~2022-03-09 接受任务,按照指导教师要求查阅资料,撰写开题报告。

2、2022-03-10~2022-03-23 进行数据收集,熟悉相关程序软件,数据的预处理等。

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