1. 研究目的与意义
棉花(Gossypium hirsutum)是我国乃至世界上最重要的经济作物之一,棉纤维是纺织业的重要原材料。中国是世界上最大棉花生产国,同时又是最大纺织用棉消费大国,纺织品出口是我国出口创汇的大宗产品,直接影响国民经济和外汇储备。同时,棉花作为经济欠发达地区农民的主要经济来源,对促进地区农村经济发展,增加农民收入都具有十分重要的现实意义。另一方面,随着1999年底以来棉花市场价格的触底反弹,适度发展棉花生产,并保持其相对稳定,对继续支持我国棉纺工业结构的调整和进一步完善,推动纺织工业发展,增强我国加入WTO后的竞争力,都具有十分重要的意义。此外,棉花是研究纤维细胞生长发育及细胞壁生物合成的理想材料之一。因此,研究棉纤维发育有关的关键基因,研究其表达模式及其在棉纤维发育的功能,对于阐明棉纤维生物合成的分子机理,进一步提高棉花的产量及改良纤维品质具有重要意义。
黄萎病是世界性的棉花重大病害,严重威胁和阻碍着棉花生产的发展。植物的细胞壁被认为是植物抗病性的重要结构因子,纤维素和果胶是形成细胞壁的主要成分,据报道GAUT蛋白与果胶的形成密切相关。因此研究GAUT蛋白的结构和功能在黄萎病抗病反应的研究中具有重要意义。本研究拟利用生物信息学研究GAUT蛋白的结构,对与优化棉纤维的品质和棉花植株抗黄萎病的研究均有促进意义。
2. 研究内容和预期目标
2.1 主要研究内容
本研究根据前期所获得的棉花gaut基因序列为基础,进行该蛋白的生物信息学分析,为后续功能研究提供基础的资料。
(1) gaut序列同源性分析;
3. 研究的方法与步骤
(1) gaut序列同源性分析:
利用在线的http://www.ncbi.nlm.nih.gov/conserved domain,分析gaut同源基因保守区。将gaut基因和其他物种的同源基因的蛋白序列在dnaman中进行聚类分析,构建进化树,判断其进化渊源。
(2) gaut蛋白的编码氨基酸序列分析:
4. 参考文献
[1] wang y, wang y, li j, li sj, chu h, tian xf. cloning, prokaryotic expression and bioinformatics analysis of giardia lamblia c2strain sumo gene[j]. chinese journal of zoonoses. 2013. 8
[2] 吴组建, 高芳銮, 沈建国. 生物信息学分析实践[m]. 北京:科学出版社, 2010.
[3] 张成岗, 贺福初. 生物信息学方法与实践[m]. 北京:科学出版社, 2002.
5. 计划与进度安排
(1)2022年11月18日至2022年12月19日:确定论文选题,与指导老师见面;
(2)2022年12月22日至2022年3月6日:接受毕业论文任务书;
(3)2022年3月6日至2022年3月20日:查阅文献资料,撰写开题报告,完成开题;
