草菇cDNA削减文库表达序列标签(EST)的分析开题报告

 2021-08-09 01:02:31

1. 研究目的与意义

草菇是我国重要的人工栽培的食用菌,它具有丰富的木质纤维降解系,并具有独特的酶学特性,在食品等工业中具有重要的应用前景,为了进一步研究系统其木质纤维生物降解酶系及机理,我们构建了草菇cDNA文库,获得的大量的EST序列信息,希望在基因组水平进一步发现新的木质纤维降解酶基因及相关信息。

2. 国内外研究现状分析

李迅等,构建草菇cDNA削减文库,并克隆了一些有价值的多糖降解酶,如木聚糖酶,β-葡萄糖苷酶,几丁质脱乙酰酶,并对他们的外源表达进行探讨。

3. 研究的基本内容与计划

1将cdna削减文库中有效的est序列通过与ncbi的非冗余核酸数据库进行blastx比对,初步确定已知功能基因,推定功能基因,未知功能基因,举例并列表。

2从所分析的有效est序列中找出所需的目的基因。

3获得所需目的基因的全长。

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4. 研究创新点

cDNA文库的构建是现代分子生物学的一项重要技术,它是指某生物发育时期所转录的mRNA经反转录形成的cDNA与某种载体连接而形成的克隆的集合。由于cDNA文库比基因组DNA文库小的多,能够比较容易从中筛选克隆得到细胞特异性表达的基因。

另外,目前关于草菇纤维素降解酶的基因信息报道还较少,许多相关的基因还未得到克隆。本研究以草菇cDNA文库为基础,可从中筛选出相关新基因。

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