1. 研究目的与意义
背景：结直肠癌（colorectal cancer，CRC）是一种起源于结肠或直肠的胃肠道恶性肿瘤，是最常见的消化道恶性肿瘤之一。根据2018年国际癌症统计研究机构(International Agency forCancer statistics)的数据，结直肠癌的发病率排名第三，死亡率排名第二，是男性第三大最常见的恶性肿瘤，仅次于肺癌和前列腺癌，也是女性第二大最常见的恶性肿瘤，仅次于乳腺癌。预计到2030年，全球结直肠癌负担将达到每年约220万新病例，较当前进一步增加20%。2018年我国结直肠癌新发病例和死亡病例分别增至52.1万例和24.5万例，在全部恶性肿瘤发病率中结直肠癌排名由第3位升至第2位，成为影响居民生命健康的重大卫生问题。lncRNA（Long non-coding RNAs，lncRNA）是一类转录本超过200个核酸，本身不参与蛋白质编码，却以RNA的形式参与多种生物学过程的分子。lncRNA通过与DNA、mRNA和蛋白质的通讯来发挥其调控作用，在各种与癌症相关的细胞过程中行使如信号、诱饵、支架和向导分子等不同的功能，在各种类型的癌细胞中异常表达。小核仁RNA宿主基因（small nucleolar RNA host genes，SNHGs）是一组lncRNA，在胃癌、乳腺癌、肝癌、前列腺癌等肿瘤中促进其进展，通过调控细胞增殖、侵袭、凋亡等过程发挥重要作用。但是，目前没有系统研究SNHG家族lncRNA在结直肠癌致病过程中的功能。
目的及意义：本研究利用生物信息学的方法，通过鉴定结直肠癌中差异表达的SNHG基因，分析SNHG家族的表达模式、在结直肠癌中的发生和转移能力、与患者预后的相关性和ceRNA调控网络等，揭示SNHG家族lncRNA在结直肠癌致病过程中的作用，为结直肠癌的诊断和治疗提供理论依据。
2. 研究内容和预期目标
主要研究内容：
⑴ snhg基因的收集与在泛癌中的表达图谱分析
⑵结直肠癌癌症和癌旁组织差异表达snhg基因的鉴定
3. 研究的方法与步骤
⑴ensembl数据库(https://www.ensembl.org)检索snhg基因家族成员
⑵在ncbi的pubmed数据库（https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/）中检索有关snhg基因在结直肠癌中行使功能的文献
⑶ 从oncomine数据库（https://www.oncomine.org）下载snhg基因在泛癌中的表达图谱并进行分析
4. 参考文献
[1]jingjing,h., et al., unfolded protein response in colorectal cancer. cell bioscience, 2021. 11(1).
[2]国家卫生健康委员会中国结直肠癌诊疗规范(2020年版). 中华胃肠外科杂志,2020. 23(06): p. 521-540.
[3]韩丽芳, etal., 结直肠癌患者临床特征和病理类型特征分析. 泰山医学院学报, 2019. 40(08): p. 620-621.
5. 计划与进度安排
⑴第17周（20-21-1学期）-第3周（2022年12月28日--2022年3月21日）：根据和导师讨论确定的论文题目，大量阅读文献，其中选择10篇以上参考文献（外文1-2篇或以上）进行深入阅读，参照任务书写出开题报告。选择一篇外文（5000字以上，文献内容要结合本研究内容）进行全文翻译。
⑵第4周（2022年3月22日--2022年3月28日）：在充分调研文献的基础上，制定实验具体实施计划，进行试验研究的前期准备工作；
⑶第5周-第11周（2022年3月29日--2022年5月16 日）：根据任务内容实施试验，包括snhg长链非编码rna基因家族的鉴定；snhg长链非编码rna在泛癌中的表达谱分析；snhg长链非编码rna在结直肠癌不同进展阶段的表达分析； snhg长链非编码rna表达与结直肠癌患者预后的相关性分析； snhg长链非编码rna介导的cerna调控网络分析等；
