1. 研究目的与意义
近年来，为了防治病虫草害，提高棉花产量，农药、化肥、除草剂、调节剂和农地膜等生产资料的用量不断增大，棉田农药、化肥和残膜的污染日渐严重；棉田多熟套种、铁茬播种和棉田轮作倒茬困难，棉田土壤病菌积累增加，病虫危害日趋严重等，都对农业生态环境造成了很大压力。高温、低温、干旱和高盐等非生物胁迫也对棉花的生长及发育产生重大影响,甚至降低其产量和品质。这些原因大大提高了棉花的生产成本、加大了增效难度。
由于植物生长的不可移动性使其必须适应不同的环境条件,植物已经在长期的进化中进化出了应对胁迫的一系列反应机制,例如通过复杂的信号转导系统来激活或抑制体内的生理生化过程从而提高对外界胁迫的抗性。经研究发现，海藻糖在植物响应胁迫过程中发挥着重要的作用。
海藻糖合酶主要作用是催化底物转化生成海藻糖。海藻糖累积于植物体内，具有很强的抗脱水作用，在干旱、寒冷、高盐碱条件下可保护生物膜、蛋白质等免受伤害，为植物提供保护功能，从而改良植物的某种不良性状，达到优化育种效果。在植物抗逆研究中，海藻糖合酶基因（trehalose-6-phosphatesynthase，tps）是继谷氨酸、辅氨酸、甜菜碱合成酶基因之后又一个与抗逆相关的基因，因而海藻糖代谢调控和植物遗传转化的研究引起了人们的高度重视。
2. 研究内容和预期目标
2.1 主要研究内容
利用前期研究所获得的多态性片段为基础，利用国际生物信息学数据库和相关的生物信息学软件，blast分析在植物中同源6-磷酸海藻糖合成酶基因的est序列，通过电子延伸得到棉花中的该基因完整开放阅读框，为后续功能研究提供基础的资料。
具体包括以下几个方面：
3. 研究的方法与步骤
本研究主要采用生物信息学的分析方法，具体包括以下方面：
（1）种子序列分析
利用前期研究所获得的多态性片段为基础，利用gnebank中的植物同源tps基因的est数据，进行比对分析，确定该多态性片段在tps基因中的可能位置和基因长度。
4. 参考文献
1.吴组建, 高芳銮, 沈建国. 生物信息学分析实践[m]. 北京:科学出版社, 2010.
2. 张成岗, 贺福初. 生物信息学—方法与实践[m]. 北京:科学出版社, 2002.
3.高兴春, 顾雪峰, 韩俊, 朱大海. 基于电子克隆方法获得鸡mibp全长cdna . 生物信息学, 2005,3(2): 58-61,88
5. 计划与进度安排
（1）2022年10月19日至2022年12月25日：与指导老师见面，确定论文选题；
（2）2022年12月26日至2022年1月26日：接受毕业论文任务书；
（3）2022年2月16日至2022年3月10日：查阅文献资料，撰写开题报告，完成开题；
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