以MK2、CHK1等为靶点的抗肿瘤活性成分分子对接筛选开题报告

 2022-02-17 20:46:19

1. 研究目的与意义

背景:癌症严重危害人类的健康,长期以来,虽然大量的抗肿瘤药物问世,但癌症的复发率、死亡率以及药物耐药性依然居高不下。近年来,随着靶向药物的问世,给广大癌症患者带来了新希望。目前随着合成药物开发难度越来越大,表现在开发费用激增,周期延长、成功率大幅下降、造成环境越来越严重等等,难以为广大人们群众所承受,所以科学家又重新将新药开发的目光关注到天然产物上。天然产物是新药开发的重要分支和捷径之一。在我国,天然产物已有数年来的药用历史,而天然产物因其价格较为低廉,是我国疾病防治的首选药物。

天然产物是指动物、植物、微生物、海洋生物和矿物等自然界中存在的有药理活性、可做药用的药用天然产物。以天然产物为主的新药研究就是要从天然资源(包括中药、植物或草药)中寻找有效成分,发现具有开发前景的新类型结构化合物作为先导化合物,经结构修饰和改造,寻找疗效更高、结构更简单并且便于大生产的、安全有效的候选化合物,再经过临床验证判断这种化合物是否能作为新药上市,这是一条行之有效的创新药研究途径。近年来,天然产物因具有抗肿瘤活性成分的发现,而成为抗肿瘤新药研发的热点和重点之一,多种中草药及其有效活性成分已被广泛证实具有抗肿瘤活性,例如蟾酥、蔓荆子等。蟾酥为中华大蟾蜍的干燥皮,其最早记载于《本经逢原》,具有抗肿瘤、抗病毒作用。其水溶性制剂—华蟾素,已被国家食药监局批准上市,广泛用于治疗各种癌症。但其成分较多且复杂,尚不完全明确,且缺乏活性成分于药理作用之间的关系研究。蔓荆子,一种传统中药,始载于《神农本草经》,有疏散风热、祛风胜湿、清理头目等功效。近年来,大量研究发现其提取物具有抗肿瘤作用。其所含的黄酮木樨草素可有效抑制白血病细胞的增殖并诱导凋亡。李文欣等从蔓荆子中分离获得15种具有抗肿瘤作用的活性成分。虽然,这些中草药及其活性成分的抗肿瘤活性已被证实,但其作用靶点及其调控机制尚不明确。

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2. 研究内容和预期目标

研究内容:本文重点在于讨论从天然产物中筛选找寻潜在的抗肿瘤药物。本论文拟通过大量的文献查询,找寻癌症发生的关键因子,以此作为靶蛋白;查阅相关抗癌临床数据,确定候选中草药,并找寻其已报道的活性成分;最后,采用分子对接软件igemdock进行潜在抑制剂的预测。

计算机筛选是建立在理论计算‐药物设计‐化学合成‐生物筛选有机结合的基础上,成功的筛选可以大大减少生物筛选的工作量,提高新药研发成功的概率.本研究采用分子对接技术的原理是以小分子化合物为探针,在已知结构的靶标数据库中检索可能与之相结合的生物大分子,并通过能量匹配和空间的调整形成分子复合物,进而预测药物发挥作用的靶标。近年来,有关蟾酥的药理活性研究日益广泛。然而,大多仍然处于简单的细胞实验和动物药效验证的阶段,其作用机制仍尚待进一步阐明。

具体操作为:

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3. 研究的方法与步骤

研究方法:

1.文献研究法:搜集整理相关研究资料,为研究做准备;

2. 通过检索pdb蛋白质数据库,找寻mk2、chk1等靶蛋白的晶体结构;

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4. 参考文献

[1]司书毅,张月琴.药物筛选:方法与实践[m].北京:化学工业出版社,2007.[2]李家璜,胡桉,郑伟娟,等.计算机模拟筛选雷公藤内酯醇治疗银屑病的靶标蛋白[j].中国药学杂志,2014(13):1133‐1138.[3]陈少军,陈宏降,郭章华.反向分子对接法预测丹参醇a的潜在靶点[j].中药药理与临床,2014,30(5):58‐61.

[4] gisbert schneider.nature chem.,2016,8, 531-541, doi: 10.1038/nchem.2479

[5]崔明超,崔文, 陈少军,等. 基于计算机虚拟筛选技术的芹菜素靶标的预测[j].重庆医学, 2016, 45(27):3821-3823.

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5. 计划与进度安排

2022-2022-1学期第17-20周-2022-2022-2学期第1-4周(2022.11.25-2022.03.31)查阅文献,完成开题报告的撰写。找寻并确定靶蛋白和候选中草药;完成翻译;

第5-6周(2022.04.01-2022.04.15)找寻所确定的靶蛋白的晶体结构;

第7-8周(2022.04.16-2022.04.29)找寻候选中草药中已报道的活性成分,并绘制其结构图;

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