1. 研究目的与意义
盘龙参,陆生植物,为兰科植物绶草的根和全草,生于海拔400-3500m的山坡林下、灌丛下、草地、路边或沟边草丛中,分布几遍全国。《天宝本草》、《滇南本草》、《陆川本草》中记载,具有添精壮阳、滋阴补虚、益气养阴,清热解毒等功效。常用于病后虚弱,阴虚内热,咳嗽吐血,头晕,腰痛酸软,糖尿病,遗精,淋浊带下,咽喉肿痛,毒蛇咬伤,烫火伤,疮疡痈肿。天然产物化学研究显示,盘龙参的主要活性成分有盘龙参酚、盘龙参二聚菲酚等二氢菲类化合物和阿魏酸酯成分等小分子有机化合物。近年来,大量研究显示盘龙参具有抗肿瘤活性,但是,其抗肿瘤活性靶点、抗肿瘤活性成分等均不明确。本次研究就是用分子对接软件,预测盘龙参潜在活性成分的抗肿瘤靶点。
分子对接技术是20世纪90年代发展起来的一种虚拟的仿真技术,分子对接主要是依托于拉马克遗传算法进行分子优化处理。分子对接是将已知三维结构数据库中的分子逐一放在靶标分子的活性位点处,通过不断优化受体化合物的位置、构象、分子内部可旋转键的二面角和受体的氨基酸残基侧链和骨架, 寻找受体小分子化合物与靶标大分子作用的最佳构象, 并预测其结合模式、亲和力和通过打分函数挑选出接近天然构象的与受体亲和力最佳的配体的一种理论模拟分子间作用。
2. 研究内容和预期目标
主要研究内容和预期目标主要研究内容:
1)找寻盘龙参的有效成分;
2)找寻肿瘤中关键的原癌基因的蛋白结构;(pi3k和mtor等的蛋白结构)
3. 研究的方法与步骤
1、molview网站上绘制茅阿魏酸酯、盘龙参酚、sinenol a等盘龙参有效成分的结构式;
2、pdb网站找寻mek1、top1、mtor、pi3k、fak1等蛋白的结构;
3、igemdock分析茅苍术有效成分的抗肿瘤靶点;
4. 参考文献
[1]尹永芹, 赵英日, 崔红花, 等. 盘龙参的化学成分研究. 中国实验方剂学杂志. 2013, 19(19):76-78.
[2]赵英日, 王淑美,崔红花, 等. 盘龙参中总黄酮提取工艺研究. 中国民族民间医药杂志. 2011, 20(14):46-48.
[3] 吴道宏, 欧阳玉祝. 大孔树脂对盘龙参多酚的吸附工艺优化. 应用化工. 2011, 40(12):2080-2083.
5. 计划与进度安排
第一周 查阅文献、学习相关实验技术;
第二周——第四周 找寻盘龙参有效成分、肿瘤原癌基因的结构;
第五周——第八周 igemdock分析盘龙参有效成分的抗肿瘤靶点;
