1. 研究目的与意义
1.1研究背景
棉花是世界上最主要的农作物之一，产量多、生产成本低，使棉制品价格比较低廉。棉纤维能制成多种规格的织物，适于制作各类衣服、家具布和工业用布。棉织物坚牢耐磨，能够洗涤和在高温下熨烫。我国是棉花产量大国之一，而当前我国棉花市场的供需情况是，库存高、产量下降、需求减少、棉花价格走低、国内外棉价差缩小、棉花进口量减少，在新的市场情况下，我国的棉花产业面临新的挑战和发展：其价格缺乏竞争力，质量难以满足下游纺织企业的需求。
中华全国供销合作总社棉麻局局长中国棉花协会常务副会长高芳表示尽管近几年国内棉花的消费量表面在减少，但是通过进口棉花和棉纱，我国总体上依然保持每年1000万吨左右的棉纤维的消费能力。未来，我国将向建成纺织强国方向迈进，纺织产业的规模和纺织品服装的消费将继续增长，这为棉花消费打下了坚实的基础。棉花行业供给侧改革的目标之一是提升棉花的质量，让生产的棉花能够适应消费升级的需要，推进供给与需求相互匹配。工业和信息化部消费品司处长曹学军认为，只要棉花的质量好，棉花的消费空间依然广阔。提高棉花的质量，首先要提高的是棉纤维品质。影响棉纤维生长发育的主要因素是基因型、激素、温度、水分、光照、授粉受精状况等。基因型决定棉纤维分化发育方式，棉纤维分化发育机理的研究对于人为控制棉纤维生长发育，提高棉纤维产量和品质有较大意义。由此可见棉纤维品质尤其是强度是目前棉纤维品质改良的重点。
2. 研究内容和预期目标
2.1研究内容
本研究根据前期所获得的陆地棉uxs基因序列为基础，根据海岛棉棉种的偏爱密码子，对其基因序列进行密码子优化，内容如下：
3. 研究的方法与步骤
(1) 棉属植物密码子偏爱分析
根据ncbi的genbank所记录的海岛棉基因uxs的基因序列，递交到emboss（http://genopole.toulouse.inra.fr/bioinfo/emboss），分析其密码子的使用情况,然后运行emboss的cusp程序，得到的密码子使用频率表统计，据此说明各氨基酸的高频率密码子。
(2) 陆地棉uxs基因的蛋白序列分析
4. 参考文献
[1]吴组建, 高芳銮, 沈建国. 生物信息学分析实践[m]. 北京：科学出版社, 2010.
[2]张成岗, 贺福初. 生物信息学-方法与实践[m]. 北京：科学出版社, 2002.
[3]胡桂兵, 张上隆, 徐昌杰,等. 韧皮部特异启动子驱动密码子优化的抗菌肽d基因的植物表达载体构建[j]. 果树学报, 2005, 22(6):639~643.
5. 计划与进度安排
（1）2022年11月18日至2022年12月23日：与指导老师见面，确定论文选题；
（2）2022年12月24日至2022年2月13日：接受毕业论文任务书；
（3）2022年2月14日至2022年3月10日：查阅文献资料，撰写开题报告，完成开题；
