1. 研究目的与意义
1.1研究背景
海岛棉又称长绒棉，其纤维细长、富有丝光、强力高，是纺制高档和特种棉纺织品的重要原料。海岛棉原产于中美洲、南美洲和加勒比地区，现广泛分布于埃及、苏联、苏丹、美国、摩洛哥、秘鲁、中国等地，品质以埃及“uiza”系列品种最优秀，是纺织工业的上等原料，被誉为“白金”。
近年来，高产和优质是海岛棉育种者主要的育种目标，然而产量性状与品质性状间存在明显的负相关。在育种的过程中既要选择高产性状，又要兼顾纤维品质好的性状，同时在推广应用层面既要考虑植棉者的利益，又要兼顾后续产业链的需求，这对育种工作者提出了更高的要求。
2. 研究内容和预期目标
2.1研究内容
本研究根据前期所获得的海岛棉adf基因序列，参照棉花的偏爱密码子，对其基因序列进行密码子优化，为进一步在陆地棉中高效表达adf基因奠定基础。
(1) 棉属植物密码子偏爱分析
3. 研究的方法与步骤
(1)棉属植物密码子偏爱分析
从美国国家生物技术信息中心（national center for biotechnology information ，ncbi)建立的dna序列数据库所记录的部分棉种植物基因的遗传密码中获取海岛棉adf2000条以上的陆地棉基因cds序列数据，然后利用emboss（http://genopole.toulouse.inra.fr/bioinfo/emboss）软件分析其密码子使用频率，从而可以分析出陆地棉棉种的密码子偏爱，为下一步的实验做准备。
(2)海岛棉adf基因的蛋白序列分析
4. 参考文献
[1]吴组建, 高芳銮, 沈建国. 生物信息学分析实践[m]. 北京：科学出版社, 2010.
[2]张成岗, 贺福初. 生物信息学-方法与实践[m]. 北京：科学出版社, 2002.
[3]胡桂兵, 张上隆, 徐昌杰,等. 韧皮部特异启动子驱动密码子优化的抗菌肽d基因的植物表达载体构建[j]. 果树学报, 2005, 22(6):639~643.
5. 计划与进度安排
（1）2022年11月18日至2022年12月23日：与指导老师见面，确定论文选题；
（2）2022年12月24日至2022年2月13日：接受毕业论文任务书；
（3）2022年2月14日至2022年3月10日：查阅文献资料，撰写开题报告，完成开题；
