1. 研究目的与意义、国内外研究现状(文献综述)
意义与前景:许多天然产物中的卤素取代基深刻影响着其生物活性,例如万古霉素,氯霉素,金霉素,瑞拜克霉素[1]。
譬如,瑞拜克霉素是由色氨酸衍生而来的吲哚咔唑家庭成员,能抑制拓扑异构酶i和ii[2],能抑制蛋白激酶c而具有抗癌活性[3],瑞拜克霉素的生物合成早期途径中,初始底物l-色氨酸首先在卤化酶rebh的作用下形成7-氯-l-色氨酸[4-5] 。
本次研究中,通过简并引物筛选宏基因组文库获得卤化酶相关基因,进而为设计特异引物筛选出包含卤化酶基因的单克隆,进一步研究产生具有生物活性的卤化物的潜力打下基础。
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2. 研究的基本内容和问题
研究目标与内容:通过简并引物筛选宏基因组文库获得卤化酶相关基因,将筛选出来的卤化酶基因成功导入感受态细胞中。
然后进行含卤化酶相关基因的单克隆筛选,确人相关的卤化酶基因得以转入成功。
拟解决的关键问题:首先得从基因文库中通过pcr成功的找到相关卤化酶基因,并与载体成功连接。
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3. 研究的方法与方案
研究方法,技术路线以及实验方案:首先将基因文库中的质粒进行pcr,体系为质粒,dmso,左右引物,mix以及水补充到适当的体系,进行pcr。
将pcr后的体系进行跑胶。
胶为1%的胶,从中发现目的条带。
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4. 研究创新点
宏基因组学技术是一种不依赖于微生物培养的技术,直接从环境样品中提取微生物全部遗传物质,与合适载体(连接,转化到宿主菌中建立宏基因组文库。
然后对文库进行分析与筛选,得到新的基因或生物活性产物。
突破了微生物的培养瓶颈,是极具潜力的新方法。
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5. 研究计划与进展
研究计划:从基因文库中,通过pcr筛出相关卤化酶基因,然后通过电转化,将目的基因导入感受态菌内。
进行单克隆筛选出携带有卤化酶基因的菌。
预期进展:一个星期内筛选出卤化酶基因,然后做电转化单以及单克隆筛选。
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