1. 研究目的与意义、国内外研究现状(文献综述)
传统的酵母菌鉴定主要依据其形态特征和生理特征,一般情况下要对一株酵母进行鉴定到种,工作量大而且耗费时间,而且这些特征容易受到培养条件等的影响而出现不确定的结果[1]。随着生物技术的发展,利用分子生物学技术对酵母菌进行鉴定的方法已逐渐成为最主要和最常用的方法,主要包括dna限制性片段多态性分析(pcr-rflp),核糖体dna序列分析,脉冲电泳核型分析(pfge),随机扩增多态性dna(rapd),以及t-rflp、实时pcr技术(realtime-pcr)、dna重组探针的指纹图谱技术和微卫星分子标记技术等。本课题主要采用的是26srdna基因d1/d2区序列分析法。kuttzmanrobnett(1998)测定了大约500种酵母菌的大亚基26srdna的d1/d2可变区的序列,发现用这段序列(500-600bp)可以将绝大部分的种区分开,同一种内不同菌株间d2区的核苷酸差异不超过1%[2]。这些序列均已公布在genbank等国际核酸序列数据库中,因此给酵母菌的分子生物学分类研究提供了很大方便。[3]随着dna序列分析技术的日趋成熟和简易化,rrna基因(rdna)的序列分析被越来越多的应用于酵母菌的分类学研究中。
[1]刘小珍,张汉尧.昆明葡萄酒相关酵母菌的分离与鉴定[j].西北农林科技大学学报,2014,(5):135-140
[2]cletusp.kurtzman&christiej.robnett.identificationandphylogenyofascomycetousyeastsfromanalysisofnuclearlargesubunit(26s)ribosomaldnapartialsequences[j].antonievanleeuwenhoek,1998,73:33137l
2. 研究的基本内容和问题
对酵母菌进行分离纯化,并对纯化后的菌株提取DNA,再经pCR扩增后,测定其26SrDNA序列,最后通过对比基因库中的序列,对酵母菌进行鉴定。本课题拟解决的关键问题是DNA的提取,若提取不出DNA则后续步骤无法进行,最终会影响整个实验。
3. 研究的方法与方案
1.研究方法:使用试剂盒提取dna,并通过26srdna基因d1/d2区序列分析法对酵母菌进行鉴定。
2.技术路线:.
3.实验方案:(1)配制样液,并梯度稀释;
(2)配制培养基,并灭菌;
(3)倒平板,涂布样品,培养;
4. 研究创新点
本课题的特色是,使用分子生物学方法对酵母菌进行鉴定。
5. 研究计划与进展
2015年12月-2016年1月:查阅文献,了解具体实验步骤,熟悉实验操作、无菌技术,以及仪器的使用等。
2016年3月-4月:对酵母菌进行分离与纯化,使用试剂盒提取dna,进行pcr扩增,以及测序鉴定、画发育树。
2016年5月:撰写毕业论文。
