利用宏基因组学功能筛选方法挖掘新型抗生素耐药基因的研究开题报告

 2022-01-29 18:50:54

1. 研究目的与意义、国内外研究现状(文献综述)

1 研究意义

抗生素是20世纪最重要的医学发现之一。自四十年代以来,抗生素对控制人类及动物感染性疾病发挥了巨大的作用。然而近年由于在人医临床及农业中的滥用,病原菌中耐药表型大范围爆发。耐药菌的不断涌现和迅速传播在世界范围内引起了广泛的关注。世界卫生组织(who)已将抗生素耐药基因(args)列入21世纪威胁人类健康的最重大挑战之一,并宣布将在全球范围内对控制args进行战略部署。2006年args正式被列为一类新型环境污染物,它对环境、生态系统及人类健康的威胁也成为新的研究热点。耐药病原菌,尤其是多重耐药菌的爆发暴露了我们对细菌进化进程认识的不足。本项目利用宏基因组学方法研究土壤宏基因组文库中的新型耐药基因,从而试探索自然环境中耐药基因的来源及特性,为研究其生态作用、转移机制打下基础,进而为临床上细菌耐药性的预测和控制提供必要支持。

2 国内外研究概况

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2. 研究的基本内容和问题

1 研究目标

我国拥有丰富的土壤环境和具有特色的土壤生态系统,其中的大量微生物类群蕴含着许多有待发掘的具有特殊生理、生态效应的新物种以及相应的天然产物资源。但由于我国宏基因组学相关研究起步较晚,尚未形成规模,因而有关运用宏基因组学方法发掘新型功能基因的报道仍然很少。本项目旨在应用利用宏基因组学功能筛选的方法在已有土壤宏基因组文库中挖掘新型的耐药基因,试探索自然环境中耐药基因的来源和功能,进而为临床上细菌耐药性的预测和控制提供必要支持。

2 研究内容

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3. 研究的方法与方案

1 研究方法及实验方案

1.1耐药表型阳性克隆筛选及其亚克隆的构建

选取四环素为底物,以clsi中规定的大肠杆菌对不同药物的耐药中介浓度添加不同抗生素于lb平板,用抗性平板法筛选文库中具有耐药表型的阳性克隆。用sau3a i对该cosmid质粒dna进行不完全酶切,产物经酶切后连接载体并转化感受态细胞。

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4. 研究创新点

我国宏基因组学相关研究起步较晚,有关运用宏基因组学方法发掘新型功能基因的报道仍然很少。而本项目利用宏基因组学的方法研究土壤中不可培养微生物,进一步挖掘其中的微生物耐药基因资源,筛选得到含新型耐药基因的阳性克隆,为未来发掘新型耐药机制提供了理论及技术支持。

5. 研究计划与进展

1. 项目进展及计划

2014.10

摸索抗性平板的功能筛选方法条件;

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