microRNA调控的卵巢癌相关信号通路分析开题报告

1. 研究目的与意义

卵巢癌是女性生殖器官最常见的恶性肿瘤之一，发病率仅次于宫颈癌和子宫体癌位居于世界第三位，然而其死亡率却超过其余两者之和，高居于妇科癌症首位，是严重威胁妇女健康的最大疾病。卵巢癌的易发人群主要有以下几种：丁克一族、都市白领、经常使用安全套的人、有家族遗传的人、持续腹痛的中年女性。

卵巢癌一般多见于更年期和绝经期妇女，其发病原因有环境因素、内分泌因素、遗传和家族因素等。卵巢癌可发生于任何年龄，年龄越高，发病越多。卵巢癌的高死亡率和不良预后决定了其早期诊断的必要性和迫切性。卵巢癌的诊断方法通常有以下三种：一般是对可疑患者进行盆腔检查以及抽血检查ca-125。进一步检查包括阴道内超声检查、ct检查或核磁共振检查，以此可以观察卵巢是否有肿瘤生长。最后采取的诊断步骤是活检。而治疗方法通常有以下四种：手术治疗、化学治疗、放射化学治疗以及中药治疗。

基因芯片，又称dna芯片、生物芯片，其测序原理是杂交测序方法，即通过与一组已知序列的核酸探针杂交进行核酸序列测定。microrna是一类内源性的、长度约为24个核苷酸的小rna，其在细胞内具有多种重要的调节作用，在不同组织、不同发育阶段中的microrna的水平有显著差异，这种microrna表达模式具有位相性和时序性，提示着micrornas有可能作为参与调控基因表达的分子，因而具有非常重要的意义。

2. 研究内容和预期目标

研究内容：

在本课题的研究中，我们将以卵巢癌microrna表达谱数据及其配对mrna表达谱为研究对象，寻找癌症样本中差异表达的microrna分子，并利用mrna表达谱对microrna候选标记物分子进一步优化，并对其进行诊断力评价。

此外我们还将进一步把microrna标记物分子调控的靶基因映射到分子通路，力争发现新颖的卵巢癌相关的分子信号通路，并利用cytoscape构建microrna-mrna分子调控网络，寻找卵巢癌中microrna调控的模块。

3. 研究的方法与步骤

研究方法：

通过检索各大基因表达谱数据库，找出卵巢癌microrna表达芯片数据及其配对的基因表达芯片数据，整理芯片信息，进行下一步分析。采用多种差异基因表达分析软件，针对芯片数据寻找出在癌症样本中差异表达的microrna。将差异microrna取交集，进行比较，找出最适合的方法用于下一步研究。通过数据库检索和预测软件寻找癌症中差异表达microrna所调控的靶基因。

4. 参考文献

[1]xu,l.,d.geman,andr.l.winslow,large-scaleintegrationofcancermicroarraydataidentifiesarobustcommoncancersignature.bmcbioinformatics,2007.8:p.275.

[2]cahan,p.,etal.,meta-analysisofmicroarrayresults:challenges,opportunities,andrecommendationsforstandardization.gene,2007.401(1-2):p.12-8.

[3]rhodes,d.r.,etal.,large-scalemeta-analysisofcancermicroarraydataidentifiescommontranscriptionalprofilesofneoplastictransformationandprogression.procnatlacadsciusa,2004.101(25):p.9309-14.

5. 计划与进度安排

1、2022-03-1～2022-03-09接受任务，按照指导教师要求查阅资料，撰写开题报告。

2、2022-03-10～2022-03-23进行数据收集，熟悉相关程序软件，数据的预处理等。

3、2022-03-24～2022-04-06不同统计方法寻找差异microrna的效果比较；择优采用统计算法选出卵巢癌中差异表达microrna。