1. 研究目的与意义、国内外研究现状(文献综述)
一.课题意义 三十年前大约只有200多种天然有机卤化物被发现。
当时人们认为这些卤化物大多为人工合成化合物,自然界生成的卤化物很少。
随着分离纯化技术的改进及人们对新药研究热情的不断增加,迄今为止已经从各种生物(包括细菌、真菌、各类动植物)中分离出3800多种卤化物,其中大部分由海洋生物产生[1]。
2. 研究的基本内容和问题
研究目标:通过筛选含有卤化酶基因的单克隆为探索产生卤化物的潜力打下基础,在文库中采用序列筛选来寻找相关卤化酶基因,并对相关的卤化酶基因进行克隆与分析。
研究内容:将整个土壤基因组看成一个单元而不是先培养微生物,这种方法就是宏基因组方法,而这整个土壤基因组就是宏基因组。
采用宏基因组方法,将不可培养的微生物的基因转入可培养微生物,进而进行基因功能研究与天然产物表达等。
3. 研究的方法与方案
研究方法:(1)根据设计的特异引物自身的退火温度相应地调整pcr反应的退火温度,一般特异引物退火温度应小于简并引物的退火温度,因此,用特异引物筛菌的退火温度范围介于55℃-64℃,依据不同引物而不同。
(2)先养二代菌:对需要筛菌的编号,取50-100 μl养二代菌,防止将原始菌用完。
(3)取二代菌10 μl加入至990 μl lb中,稀释成10-2;再从中取出100 μl加入到900 μl lb中,稀释10-3;再从中取出100 μl加入到900 μl lb中,稀释10-4;取10-4的菌液200 μl加入至50 ml lb中,摇匀。
4. 研究创新点
特色或创新:我国宏基因组学相关研究起步较晚,有关运用宏基因组学方法发掘新型功能基因的报道仍然很少。
而本项目利用宏基因组学的方法研究土壤中不可培养微生物,进一步挖掘其中的微生物卤化酶基因资源,筛选得到含新型卤化酶基因的阳性克隆。
5. 研究计划与进展
论文计划在 9个月的时间内完成。
(1)选题 起止时间:2016年9月(2)进行文献资料检索和阅读 起止时间:2016年9月至 11 月 (3)完成开题报告 起止时间:2017年3月 (4)论文初稿的撰写 起止时间:2017年3月至4月 (5)论文的修改和定稿起止时间:2017年4月1日至 4 月 30 日 (6)论文印刷、准备答辩 完成时间:2017年5月30日前
