致病菌分子快速检测靶点筛选开题报告

1. 研究目的与意义、国内外研究现状（文献综述）

通过blast工具筛选s.heidelberg的特异性基因，设计特异的检测引物，可用于实际食品中s.heidelberg的快速检测，其对应的特异性序列是沙门氏菌新的分子检测靶点。

　　2002 年，裴晓方等采用致病性沙门菌的 inva 基因序列设计引物, 经非选择性增菌, pcr 扩增, 电泳观察结果, 优化反应条件, 可在 12h内快速检测沙门菌。

2004 年，lin 等人改进原先基于沙门氏菌的 16s rrna 的 v3区序列设计的 2 对引物，对食品中的沙门氏菌进行了 pcr 检测发现，灵敏度和特异性优于原先的 pcr 反应。

2. 研究的基本内容和问题

设计一对灵敏的、保守性好的特异检测S.Heidelberg的引物筛选出S.Heidelberg的特异性基因，设计检测S.Heidelberg的特异性引物。

PCR体系需要优化，基因比对需要细心。

3. 研究的方法与方案

通过基因比对的方法找到S.Heidelberg的特异性基因，利用Primer Premier 5.0软件进行引物设计，优化PCR的反应体系，然后进行特异性、灵敏度及人工污染实验，并对所设计的引物进行评价。

4. 研究创新点

利用BLAST工具从Genbank中筛选S.Heidelberg的特异性基因，设计新的检测引物可用于实际食品中沙门氏菌的快速检测。

5. 研究计划与进展

2014.1-2014.2查找相关文献资料2014.2-2014.3利用BLAST筛选S.Heidelberg的特异性片段，设计引物2014.3-2014.4进行PCR扩增实验，选择特异性强的引物，并优化PCR体系2014.4-2014.5进行灵敏度实验及人工污染实验2014.5-2014.6书写报告预期筛选S.Heidelberg的特异性片段会耗时较长。