全基因组选择及其应用开题报告

 2021-08-08 12:08

1. 研究目的与意义

在农业生物的产业链中,品种培育具有十分重要的地位。

可以说,在农业生产中,谁控制了品种,谁就控制了产业。

通过选择进行品种培育是育种的重要手段,最佳线性无偏预测(Best Linear Unbiased Prediction ,BLUP)方法相比于传统的表型选择,可以提高育种值估计的准确性,加快性能改良的速度,但BLUP方法仍然存在一些问题,为了克服BLUP方法存在的问题,随着计算机和分子生物学的发展,标记辅助选择(Marker-assisted Selection ,MAS)方法被研发出来,逐渐成为分子育种的常用手段。

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2. 国内外研究现状分析

通过选择进行品种培育是育种的重要手段,传统的育种工作是基于表型选择,育种家通过观察动植物的表型根据经验选择优良后代,实现对目标性状的遗传改良。

人们有意识的根据性状来对后代进行选择,其特点是不需要了解性状形成的机理,直接对性状进行选择。

但是由于性状受环境影响很大,所以直接对性状进行选择并不一定总能够选择到控制优良性状的基因,育成一个品种需要较长的时间。

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3. 研究的基本内容与计划

首先,阐述全基因组选择的产生背景、适用范围、优劣势以及国内外研究现状等;接着详细介绍基因组选择中所使用的几种常见的模型和算法并进行简单比较;然后,列举出基因组选择的应用领域和使用的方法,查找数据,尝试用R软件编写程序进行全基因组选择(GS)分析;最后,对全基因组选择和应用进行总结与展望。

时间安排:1、查阅文献,了解研究动态,做开题报告。

2018.12.202019.3.12、理论分析,利用所学知识撰写论文初稿。

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4. 研究创新点

(1)系统梳理、分析和总结国内外研究,对全基因组选择方法和应用,对其中几种常见的基因组预测方法进行详细阐述,并分别介绍基因组选择法在动物育种和作物育种中的具体应用,对全基因组选择进行展望。

(2)尝试利用rrBLUP等R软件包,分析相关数据,进行全基因组选择分析,估计育种值,计算基因组育种值估计的准确性。

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