大豆地方品种群体产量相关性状的全基因组关联分析开题报告

1. 研究目的与意义、国内外研究现状（文献综述）

课题的意义、国内外研究进展、应用前景等（列出主要参考文献）大豆是世界上重要的粮、油兼用作物，蛋白质、脂肪等营养物质丰富，在生产和生活上扮演着重要的角色。

但是应用传统育种方法进行遗传改良已经越来越难，高产育种的进展相对缓慢。

随着生物技术的不断发展以及基因组测序技术的不断完善，为大豆产量相关性状的基因定位、基因克隆等遗传研究提供了良好的技术支撑大豆产量及相关性状均属于复杂的数量性状，其遗传体系非常复杂。

2. 研究的基本内容和问题

研究的目标、内容和拟解决的关键问题研究目的：对大豆微核心种质群体株高、主茎节数、分枝、茎粗等产量相关性状进行遗传变异分析，株型筛选鉴定，通过关联分析发掘这些大豆产量相关性状的应用潜力，为大豆合理株型的选育提供理论依据。

研究内容：本研究利用大豆地方品种群体群体，于两个环境下完熟期田间调查群体株高、主茎节数、分枝、茎粗和单株荚数等表型，对其进行遗传变异分析，明确大豆产量相关农艺性状的表型变异组成；以全基因组169028个snp标记对6个农艺性状进行全基因组关联分析，分析与这些农艺性状显著相关联的等位变异，筛选优异等位变异，并解析优异种植中这些等位变异的分布特点，为进一步亲本选配与选择提供指导。

拟解决问题：分析大豆株高、主茎节数、分枝、茎粗等产量相关性状显著相关联的等位变异，筛选优异等位变异，并解析优异种质中这些等位变异的分布特点，为进一步亲本选配与选择提供指导。

3. 研究的方法与方案

研究方法、技术路线、实验方案及可行性分析在三个环境（2017jp，2017dt）对大豆地方品种群体株高、主茎节数、分枝、茎粗、单株荚数和百粒重等6个产量相关性状进行田间调查，每个重复选取长势均匀能代表材料整体水平的5株进行测量。

具体考查方法和标准参见2006年邱丽娟主编《大豆种质资源描述规范和数据标准》，标准如下：（1）株高：从靠近主茎的地面测量至植株主茎顶端的高度，调查日期为成熟初期（r7），单位：cm。

（2）主茎节数：从子叶节为起始至成熟植株主茎顶端的节数，调查日期为完熟期（r8），单位：个。

4. 研究创新点

特色或创新之处我国作物种质资源长期库中保存大豆资源2.3 万余份, 数量居世界之首。

然而, 大豆资源在新品种培育中的利用率仅为1%左右, 导致大豆育成品种的遗传基础趋于狭窄。

主要原因是缺少对其重要经济性状的鉴定,难以定向选择有重要价值的育种亲本。

5. 研究计划与进展

2017年5月12月：整理16年收获的种子，设计三个重复，每个重复按随机区组设计，播种于南京农业大学江浦农场。

进行表型的测定；学习相关软件，处理数据；论文撰写的资料调查与阅读。

2017年1月4月：数据分析，撰写毕业论文